所属科不同，蚬子是属纲帘蛤目蚬科的软体动物，而蛤蜊属于蛤蜊科；外形不同，蚬子壳厚而坚硬，外形为圆形或近三角形，蛤蜊壳较薄，呈三角卵圆形或卵圆形；用途不同，蛤蜊有很高的食用价值，而蚬子可以食用，也可以做饵料、肥料。