土壤中的微生物种类不计其数，那么如何才能从无数的微生物中分离出我们想要的菌种。方法是大同小异，只是选用的筛选培养基不同罢了。下面以筛选具有解磷能力的菌种为例，来阐述微生物的分离纯化方法。
1.培养基
（1）无机磷细菌固体培养基（以1000mL计）
葡萄糖10g，NaCl0.3g，MgSO4·7H2O0.3g，MnSO4·4H2O0.03g，Ca3（PO4）210g，（NH4）2SO40.5g，KCl0.3g，FeSO4·7H2O0.03g，酵母膏0.4g，琼脂20g，PH为7.0～7.5。（筛选用）
（2）牛肉膏蛋白胨培养基
牛肉膏0.5%，蛋白胨1%，NaCl0.5%，琼脂2%，PH为7.2～7.4。（纯化用）
2.步骤
（1）分离
将取来的土壤样品混匀，称取1.5g样品置于试管中，用10mL蒸馏水制成菌悬液（用振荡器充分震荡），再采用倍倍稀释法制成浓度分别为10-3、10-4、10-5、10-6的菌悬液。取各个浓度的菌悬液0.1mL分别涂布于无机磷固体培养基上面，每个浓度涂三个平板，涂布完成后将其在37℃下培养适当时间，待长出菌落。
（2）纯化（划线法）
