中队辅导员不一定是班主任。中队辅导员有一部分不是班主任，比如数学老师、体育老师以及音乐老师都可能是中队辅导员，但是大多数的辅导员是由学校教师中的班主任兼任的。
班主任，是指一个班的主任，又叫班级主任，班主任是学校中全面负责一个班学生的健康、思想、学习和生活等工作的教师。
同时班主任也是一个班的组织者、领导者和教育者，是一个班中全体任课教师教学以及教育工作的协调者。任课教师只负责本学科教学，而班主任除了负责本科教学之外还全权负责管理一个班级，这是班主任和任课教师最本质的区别。
中队辅导员是少先队组织的指导者，少先队中队如果要聘请1名中队辅导员，那么可以由班主任或者其他教师担任。