生物多样性的层次有三个方面，分别是遗传多样性、物种多样性以及生态系统的多样性。
遗传多样性：遗传多样性是生物遗传基因的多样性，也是生物多样性的重要组成部分。任何一个物种都有大量的遗传基因，而一个物种的基因越丰富，它适应环境的能力就越强。
物种多样性：物种多样性是生物多样性的核心，它是指地球上的动物、植物以及微生物等种类的丰富程度，包括两个方面，一个是一定区域内物种的丰富程度，另一个是物种分布的均匀程度。
生态系统多样性：地球上所有物种都是生态系统当中的组成部分，结构上主要由生产者、消费者和分解者构成。