1、定义不同：郡主是由郡公主这个词演化而来的，郡公主始于东汉，一般皇女级别为县公主，但也有少数为郡公主；
公主一词起源于春秋战国时期。其名称含义为“公为之主婚”，简称“公主”。西周时期。各诸侯国的诸侯都称“公”，周朝天子通常把女儿下嫁给诸侯，而周朝天子一般是不会为自己女儿主婚的，通常是叫同姓的诸侯来主婚，于是天子的女儿就被称为公主了。
2、亲属关系：公主是皇室直系血亲，父亲或兄弟必须是皇帝；而郡主则是旁系，血缘上要远一些，通常是亲王的女儿。
3、出现时间不同：“郡主”在中国古代历史上，郡主这一概念的形成是晚于公主的。在汉朝和晋朝的时候，皇帝的女儿也被称为郡主，随着历史的发展，到了明清时期，郡主通常指的是亲王的女儿，有时候太子的女儿也称为郡主，如果太子最后成了皇帝，那么他的女儿自然也就变成公主了；而公主起源于先秦。
4、地位不同：公主的地位是一直高于郡主的地位的。
5、称号来源不同：公主，是中国古代对皇女、王女、宗女的称谓；郡主，是中国古代封建社会对皇族女性的封号。