制作工艺不同：白酱油是以脱脂大豆为原料，采用工业的方法，用食用级别的盐酸液把大豆中的蛋白质水解，然后采用一定的技术制成的氨基酸液；普通酱油是以大豆和小麦为主要原料，通过自然发酵而成的一种调味品。在此基础上，再经过提纯、调味等工艺，就制成了我们常见的生抽、老抽和蒸鱼豉油等酱油制品。
外观颜色不同：因为白酱油使用工业方法制成，没有自然发酵的过程，所以它的颜色多为淡淡的琥珀色或无色透明状；由于经过自然发酵，在微生物的作用下，普通酱油的色泽较重，一般会呈现出黑色、红褐色等颜色。
口感味道不同：因为白酱油是把大豆中的蛋白质水解为氨基酸液，而氨基酸是酱油鲜味的主要来源，所以白酱油与普通酱油相比，具有鲜味浓郁，盐度较低，口感清淡的特点；普通酱油经过发酵，味道比较丰富，酱香味浓，盐度较高，口感比较厚重。
食用方法不同：白酱油富含氨基酸，遇高温会大量挥发，所以白酱油最好在烹饪过程中快要成菜时使用，一般适用于凉拌菜、西餐和不喜上色的菜肴；普通酱油的种类很多，如生抽、老抽等，可以根据菜式的需要自由选择搭配，广泛地应用于炒、拌、焖、烧、煨等各种烹饪方法。